Pallas

在传统的药物设计流程中，对于候选化合物，最关心的往往是对于特定靶点的活性以及对于相关靶点的选择性。至于这个化合物能否在肠道中溶解，能否通过肠道的黏膜细胞进入循环系统，能否通过屏蔽异型生物质的肝脏，能否通过血液循环到达有效部位等问题，人们知之甚少。此外，化合物是否能够在体内对靶点保持足够长的药效而不被肝脏和肾脏降解或排出也是值得关注的问题。对于一个先导化合物或候选药物分子而言，除了它的活性以外，其药代动力学特征和毒性（ADME/Tox）也是决定它是否能成为一个成功药物的关键因素。据美国FDA等权威机构统计，不良的生物利用度和毒性特征在药物研发失败中所占的比例超过50%。可见，尽量在药物研制的早期对其药代动力学和毒性特征进行比较全面的评估显得尤为重要。
但是，到目前为止，药代动力学特征的高通量筛选还仅仅局限于少数几种药代动力学特征。在实验实现高通量筛选存在困难的情况下，发展有效的药代动力学特征和毒性理论预测及高通量筛选模型具有非常重要的意义。??
Pallas软件是美国CompuDrug公司（http://www.compudrug.com）开发的专门用于预测化合物吸收、分布、代谢、排泄和毒性（ADME/Tox）特征的基于知识的专家系统软件。其中包括用于预测吸收、分布和排泄特征参数的模块：pKalc，PrologP，PrologD，Rule of 5，TPSA；用于预测代谢产物的模块：MetabolExpert，MEXAlert，RetroMEX；用于预测毒性特征的模块：HazardExpert，ToxAlert，Cytotoxicity；用于快速推测化合物HPLC分离条件的模块：EluEx。

1.pKalc：预测化合物酸和碱的pKa值，误差范围为0.25pKa范围内。
2.PrologP：预测化合物的logP值，推测化合物的疏水性。
3.PrologD：预测与药物吸收和排除密切相关的logD值，可推测在人体吸收过程中不同pH值下的疏水性。
4.EluEX：快速预测一系列化合物在HPLC中的分离条件。
5.MetabolExpert：快速预测化合物在人体、植物以及光降解下的代谢产物，是一个基于规则的开放系统。
6.HazardExpert：快速预测化合物在人体、土壤无脊椎动物、鸟类和鱼类口服和吸入状态下的七种特征毒性症状，是一个基于规则的开放性的系统。
7.ToxAlert：高效率地对大量化合物进行高通量筛选。
8.MEXAlert：快速灵敏地对首过代谢的可能性和类型进行高通量筛选。
9.RetroMEX：用于寻找活性化合的物前体药物。
10.Rule of 5：五规则认为，如果化合物违背该规则（分子量＜500，氢的共体＜5个，氢的受体＜10个和Log p＜5）中的两条，那么这个化合物在人体中将很难被吸收。
11.TPSA：预测化合物的拓扑极性表面积（TPSA）。
12.Cytoxicity：预测化合物的细胞毒性。